Kuinka nopeasti koronavirus voi mutatoitua?

Uusi koronavirus, kuten kaikki muut virukset, mutatoituu tai sen genomissa tapahtuu pieniä muutoksia. Äskettäin julkaistu tutkimus ehdotti, että uusi koronavirus, SARS-CoV-2, oli jo mutatoitunut yhdeksi ja yhdeksi vähemmän aggressiiviseksi kannaksi. Mutta asiantuntijat eivät ole vakuuttuneita.

Tutkijat löysivät "L" -tyypin, jota he pitivät aggressiivisempana tyyppinä, 70%: lla virusnäytteistä. He havaitsivat myös, että tämän kannan esiintyvyys laski tammikuun alun jälkeen. Nykyisin yleisemmin käytetty tyyppi on vanhempi, "S" -tyyppi, koska "ihmisen interventio", kuten karanteenit, on saattanut vähentää "L" -tyypin leviämiskykyä, tutkijat kirjoittivat lehdessä.

Natan Grubaugh, Jelen kansanterveyskoulun epidemiologi, joka ei ollut osa tutkimusta, sanoi kuitenkin, että kirjoittajien päätelmät ovat "puhdasta spekulointia". Ensinnäkin, hänen mukaansa, mutaatiot, joihin tutkimuksen kirjoittajat viittasivat, olivat uskomattoman pienet - parin nukleotidin, geenien perusrakenteiden, järjestyksessä, hän sanoi. (SARS-CoV-2 on noin 30 000 nukleotidia pitkä).

Näillä pienillä muutoksilla ei todennäköisesti olisi suurta vaikutusta viruksen toimintaan, jos niitä olisi ollenkaan, joten olisi "epätarkkaa" sanoa, että nämä erot tarkoittavat, että kantoja on erilaisia, hän sanoi. Lisäksi tutkijat tarkastelivat vain 103 tapausta. "Se on hyvin pieni näytejoukko virusten kokonaismäärästä", Grubaugh kertoi Live Science: lle. Hänen mukaansa virusten maailmanlaajuisesti suorittamien mutaatioiden selvittäminen vaatii "ei-triviaalia vaivaa ja saattaa joskus kestää vuosia".

Muut tutkijat ovat samaa mieltä. Havainto, että koronavirus mutatoituu kahteen kantaan, L-kanta johtaa vakavampiin sairauksiin ", on todennäköisesti tilastollinen esine", Sveitsin Baselin yliopiston biologi ja fyysikko Richard Neher kirjoitti Twitterissä. Tämä tilastollinen vaikutus johtuu todennäköisesti L-ryhmän varhaisesta näytteenotosta Wuhanissa, mikä johtaa "korkeampaan näennäiseen" tapauksen kuolleisuusasteeseen, hän kirjoitti.

Kun paikallista puhkeamista on nopeasti kasvava, tutkijat ottavat nopeasti virusgenomit potilailta, mikä johtaa joidenkin virusmuunnelmien ylisuurean määrään, Neher kirjoitti. Lehden kirjoittajat myöntävät, että heidän tutkimuksensa tiedot ovat "edelleen hyvin rajallisia" ja he kirjoittavat, että heidän on seurattava suurempia tietosarjoja ymmärtääkseen paremmin viruksen kehitystä.

"Meidän ei pitäisi huolehtia"

Grubaugh on tietoinen siitä, että tällaisia ​​papereita ilmestyy tämän puhkeamisen aikana, ja se julkaisi Nature Microbiology -lehdessä 18. helmikuuta kommentin otsikolla "Meidän ei pitäisi huolehtia siitä, että virus muuttuu taudinpurkauksen aikana."

Sana mutaatio "luonnollisesti herättää pelkoja odottamattomista ja kummallisista muutoksista", hän kirjoitti. "Todellisuudessa mutaatiot ovat luonnollinen osa viruksen elinkaarta ja vaikuttavat harvoin dramaattisesti. RNA-virukset tai ne, joiden päägeneettinen materiaali on RNA: ta DNA: n sijaan, mukaan lukien SARS-CoV-2, mutatoituvat jatkuvasti, eikä niillä ole mekanismeja näiden "virheiden" korjaamiseksi, kuten esimerkiksi ihmisen solut.

Mutta suurin osa näistä mutaatioista vaikuttaa negatiivisesti virukseen. Jos mutaatiot eivät ole viruksen kannalta hyödyllisiä, ne eliminoidaan tyypillisesti luonnollisella valinnalla, evoluutiomekanismilla, jolla organismien, jotka ovat paremmin sopeutuneet ympäristöönsä, taipumus selviytyä. Muut mutaatiot selviävät ja sulautuvat viruksen "keskimääräiseen" genomiin.

Tyypillisesti useita geenejä koodaa piirteitä, kuten viruksen vakavuus tai kyky levittää muille ihmisille, Grubaugh kirjoitti. Joten virus muuttuu vakavammaksi tai siirtyy helpommin, useiden geenien on mutatoitava. Huolimatta virusten korkeasta mutaatiosta yleensä, on epätavallista löytää viruksia, jotka muuttavat niiden välitystapaa ihmisten välillä niin lyhyellä aikavälillä, hän kirjoitti.

Joten mitä tämä kaikki tarkoittaa mahdollisen rokotteen kehittämisessä?

Nämä virukset "ovat edelleen niin geneettisesti samanlaisia, että näiden mutaatioiden ei pitäisi muuttaa uutta rokotetta", Grubaugh sanoi. On "epätodennäköistä, että kehittäjien on huolehdittava tästä." Kun rokote on loppunut, virus voi kuitenkin sopeutua siihen ja kehittää resistenssin, hän sanoi, mutta ottaen huomioon, että muut RNA-virukset - kuten ne, jotka aiheuttavat tuhkarokkoa, sikotautia ja keltakuumea - eivät kehittäneet rokotusresistenssiä, tämä skenaario on epätodennäköistä.

Itse asiassa nämä mutaatiot auttavat tutkijoita jäljittämään viruksen vaiheet, Grubaugh sanoi.

Esimerkiksi ryhmä tutkijoita Brasiliassa eristi äskettäin SARS-CoV-2 kahdesta potilaasta, joilla varmistettiin olevan COVID-19 ja sekvensoivat viruksen molempien näytteiden täydelliset genomit. He havaitsivat, että genomien paitsi erottelu toisistaan, vaan myös erottivat hyvin Kiinassa Wuhanissa sekvensoitujen virusnäytteiden genomista, tutkijat kirjoittivat raportissa, jota ei vertaisarvioitu, mutta julkaistiin foorumilla. 28. helmikuuta.

Yhdeltä Brasilian potilaalta otetulla koronaviruksella oli genomi samanlainen kuin Saksassa sekvensoidulla viruksella, ja toisen potilaan virus muistutti Yhdistyneen kuningaskunnan koronaviruksen virusta. Tämä tarkoittaa, että nämä kaksi potilasta ovat yhteydessä tapauksiin Euroopassa, mutta eivät toisiinsa, Grubaugh sanoi.